Là đơn vị được giao nhiệm vụ đầu mối trong ngành Kiểm sát nhân dân để thực hiện các nhiệm vụ của Ban Chỉ đạo 389 quốc gia giao, Vụ Thực hành quyền công tố, kiểm sát điều tra các vụ án kinh tế (Vụ 3) luôn bám sát sự chỉ đạo của Chính phủ, Thủ tướng Chính phủ, Ban Chỉ đạo 389 quốc gia. Từ đó, tham mưu cho Viện kiểm sát nhân dân xây dựng các văn bản chỉ đạo, triển khai thực hiện nghiêm trong toàn Ngành.
Thực hiện Quy chế tiếp nhận, xử lý tin báo về buôn lậu, gian lận thương mại và hàng giả (ban hành theo Quyết định số 195/QĐ-BCĐ389 ngày 23/3/2020 của Ban Chỉ đạo 389 quốc gia), Công văn của Thường trực Ban Chỉ đạo 389 quốc gia, ngày 29/4/2020, Viện trưởng Viện kiểm sát nhân dân tối cao đã ban hành Quyết định số 140/QĐ-VKSTC về việc thành lập đường dây nóng và địa chỉ hộp thư điện tử tiếp nhận tin báo về buôn lậu, gian lận thương mại và hàng giả. Đồng thời, phối hợp chặt chẽ với Cục điều tra chống buôn lậu Tổng cục Hải quan để xử lý giải quyết tố giác, tin báo tội phạm; Các vụ việc có dấu hiệu hình sự, có tính chất phức tạp hai bên đều trao đổi để thống nhất quan điểm xử lý, đảm bảo việc xử lý các hành vi có dấu hiệu phạm tội buôn lậu, vận chuyển trái phép hàng hóa, tiền tệ qua biên giới, buôn bán hàng cấm được thực hiện nghiêm; góp phần tăng nguồn thu cho ngân sách nhà nước.
Trong năm, đơn vị đã tiếp nhận gần 200 thông tin qua đường dây nóng, trong đó có nhiều thông tin liên quan đến hoạt động buôn lậu, gian lận thương mại và hàng giả. Đồng thời, đã thụ lý 17 tin báo tố giác tội phạm trong lĩnh vực chống buôn lậu, gian lận thương mại và hàng giả do Cục điều tra chống buôn lậu (Tổng cục Hải quan) tiếp nhận, trong đó đã giải quyết 10 tin báo, tố giác tội phạm (khởi tố vụ án: 8 tố giác, tin báo tội phạm). Trong đó, có một số vụ việc điển hình như: Vụ án Buôn lậu, xảy ra tại Công ty TNHH kinh doanh nông nghiệp Nghĩa Phát, vụ án buôn lậu thuốc lá xảy ra tại Vùng biển Vịnh Bắc Bộ.
Bên cạnh đó, thực hiện chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ trong Chỉ thị 33/CT-TTg về tăng cường quản lý, tái sử dụng, tái chế, xử lý và giảm thiểu chất thải nhựa, Vụ 3 đã chủ động trao đổi với Cục Điều tra chống buôn lậu (Tổng cục Hải quan) và nghiên cứu hồ sơ, tài liệu các vụ việc có liên quan để phối hợp phân loại, xử lý theo quy định pháp luật. Kết quả đã khởi tố nhiều vụ án hình sự chuyển cơ quan điều tra có thẩm quyền giải quyết như: Vụ án buôn lậu phế liệu nhựa của Công ty Phương Mai xảy ra tại cảng Hải Phòng; Vụ án buôn lậu phế liệu nhựa của Công ty Phương Mai xảy ra tại Cảng Sài Gòn Khu vực I; Vụ án vận chuyển trái phép hàng hóa qua biên giới của Công ty Việt Nhật, xảy ra tại Cảng Sài Gòn Khu vực I...
Thực hiện Chỉ thị của Thủ tướng Chính phủ về quản lý, khai thác khoáng sản, các Nghị định quy định về xuất khẩu khoáng sản, xăng dầu... Vụ 3 đã phối hợp với Cục Điều tra chống buôn lậu (Tổng cục Hải quan) xác minh, xử lý một số vụ như: Vụ án khai thác tài nguyên và xuất khẩu khoáng sản quặng Bauxit của Công ty Bảo Nguyên: Vụ án buôn lậu dầu DO xảy ra tại vùng biển Vũng Tàu...
