Trong Chỉ thị, Tổng cục Hải quan yêu cầu các đơn vị thuộc và trực thuộc triển khai quyết liệt các giải pháp tạo thuận lợi thương mại, chống thất thu NSNN như: Tăng cường chống thất thu qua công tác giám sát, kiểm tra thực hiện thủ tục hải quan, kiểm tra sau thông quan, thanh tra chuyên ngành, đấu tranh chống buôn lậu, gian lận thương mại; tập trung kiểm tra, chống gian lận về số lượng, giá trị, mã số, xuất xứ, nhãn hiệu hàng hoá... Kiểm soát chặt chẽ, kịp thời ngăn chặn việc vận chuyển trái phép, thẩm lậu vào nội địa; nhập khẩu hàng hoá giả mạo nhãn hiệu, vi phạm quyền sở hữu trí tuệ; hàng hoá thuộc diện cấm NK; hàng hoá đang chịu sự giám sát hải quan (hàng gia công, quá cảnh, sản xuất xuất khẩu...).
Nâng cao hiệu quả công tác trực ban trong toàn Ngành nhằm phòng ngừa, ngăn chặn, phát hiện và xử lý nghiêm các hành vi vi phạm; tăng cường kỷ cương, kỷ luật thi hành công vụ; chú trọng phân tích, xác định trọng điểm, chỉ đạo kiểm tra các thông tin nghiệp vụ có dấu hiệu rủi ro, đảm bảo không bỏ lọt hành vi vi phạm.
Thực hiện nghiêm cơ chế phối hợp phát hiện, xử lý sai phạm trong quá trình kiểm tra, thanh tra, kiểm toán, điều tra, truy tố, xét xử, thi hành án. Kịp thời chuyển hồ sơ vụ việc có dấu hiệu tội phạm về kinh tế tham nhũng, tiêu cực đến cơ quan điều tra để thụ lý, điều tra xử lý theo quy định của pháp luật. Khẩn trương rà soát, khắc phục hoặc kiến nghị khắc phục những sơ hở bất cập trong cơ chế, chính sách, pháp luật mà các đoàn kiểm tra giám sát, thanh tra đã kiến nghị, đề xuất.
Bên cạnh đó, các đơn vị có biện pháp, phòng ngừa các biểu hiện của hành vi cửa quyền, hách dịch, sách nhiễu, trì hoãn giải quyết công việc được giao, thờ ơ, vô cảm với doanh nghiệp và người dân, gây khó khăn đối với tổ chức, cá nhân; gợi ý nhận tiền, quà biếu của cơ quan, tổ chức, cá nhân; tình trạng "tham nhũng vặt"... Kiểm điểm, làm rõ trách nhiệm của tập thể, cá nhân nhất là người đứng đầu để xảy ra các vụ án, vụ việc tham nhũng, tiêu cực trong ngành, lĩnh vực, cơ quan, đơn vị thuộc phạm vi phụ trách, quản lý, đặc biệt là những trường hợp vi phạm pháp luật bị khởi tố, bắt tạm giam, gây bức xúc trong xã hội.